Si riconoscono oltre 150 malattie che possono giovarsi delle ozonoterapie. Molte di queste sono patologie di interesse neurologico, vascolare e soprattutto ortopedico e reumatologico.

L'elenco delle patologie muscolo scheletriche che beneficiano della ozonoterapia è veramente lungo:

discopatie cervicali e lombari, ernie discali cervicali e lombari, sindrome aderenziale post chirurgia vertebrale, artrosi nelle diverse localizzazioni (gonartrosi, coxartrosi, artrosi delle caviglie, artrosi delle spalle, artrosi vertebrali), geriartriti, sindrome del tunnel carpale, tendiniti, legamentiti, neuromi di Morton, borsiti, lesioni traumatiche di muscoli, tendini, borse e legamenti.